Nakon što su ga Morpheus (L. Fishburne) i Trinity (C.-A. Moss) oslobodili nadzora strojeva i virtualnog života, mladi Thomas "Neo" Anderson (K. Reeves) još uvijek sasvim ne vjeruje da je Odabrani koji bi, prema tvrdnjama proročice Oracle (G. Foster), ljudske parazite i pobunjenike iz kolonije Zion mogao osloboditi zatočeništva u parazitskoj Matrici. Zbliživši se s Trinity, Neo je u njoj pronašao ženu svog života, ali ga muče tjeskobni snovi o djevojčinoj pogibiji. Istodobno, neuništivi agent Smith (H. Weaving), udarna snaga Matrice kreirana za uklanjanje mogućih pogrešaka sustava, postaje sve moćniji i stječe sposobnost umnogostručivanja. A među borcima na Zionu svojom se hrabrošću uz krutog zapovjednika Locka (H. Lennix) izdvajaju požrtvovni obiteljski čovjek Link (H. Perrineau Jr.) i odlučna kapetanica Niobe (J. Pinkett Smith). Zionom, posljednjim uporištem ljudskog otpora strojevima smještenom duboko pod površinom Zemlje, vlada vijeće kancelara među kojima u Nea najviše vjeruje iskusni Hamann (A. Zerbe). Prilikom još jednog razgovora s Oracle, tijekom kojeg posumnja da je i ona dio Matrice, Neo dozna da što prije mora pronaći Ključara (R. Duk Kim), čovjeka uz čiju pomoć bi mogao doprijeti do samog Arhitekta (H. Bakaitis), stvoritelja Matrice. No da bi pronašao Ključara, Neo se mora susresti s podlim Merovingianom (L. Wilson), šefom podzemlja i ljubavnikom lijepe Persephone (M. Bellucci)...
Nakon što je njihova likovno fascinantna, iznimno stilizirana, akcijski nabrijana i tematski razmjerno intrigantna i inovativna fantastična akcijska triler drama "Matrix" (1999) praktički preko noći stekla kultni status, darovita braća Andy i Larry Wachowski (Bound), potpisnici scenarija za hitove "Ubojice" Richarda Donnera i "O kao Osveta" Jamesa McTeaguea, odlučila su u kontinuitetu snimiti dva nastavka filma i zaokružiti priču o pobuni preostalih svjesnih ljudi protiv strojeva koji lažnom, računalno kreiranom stvarnošću, parazitiraju na ljudima.